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清研智庫:Nature稱華南農(nóng)大的研究成果并沒有涉及穿山甲的整個(gè)基因組

穿山甲是主要的嫌疑人,但大量的遺傳學(xué)分析尚未找到確鑿的證據(jù)。

清研智庫:Nature稱華南農(nóng)大的研究成果并沒有涉及穿山甲的整個(gè)基因組

穿山甲經(jīng)常被偷運(yùn)到中國(guó),因?yàn)槟抢飳?duì)它們的肉和鱗片有需求。

科學(xué)家們正在競(jìng)相在世界范圍內(nèi)尋找造成嚴(yán)重破壞的冠狀病毒的來源。三周前,中國(guó)科學(xué)家根據(jù)遺傳分析建議,這種身披鱗甲以螞蟻為食的穿山甲是主要嫌疑人。但是現(xiàn)在科學(xué)家們已經(jīng)檢查了上周發(fā)布的其他三項(xiàng)穿山甲冠狀病毒基因組研究數(shù)據(jù),并說,盡管穿山甲仍然是被懷疑對(duì)象,但這個(gè)謎團(tuán)還遠(yuǎn)未被解開。

公共衛(wèi)生官員希望控制病毒的來源,以防止新的爆發(fā)。科學(xué)家認(rèn)為,這種病原體是從動(dòng)物身上轉(zhuǎn)到人身上的,就像其他冠狀病毒一樣。例如,導(dǎo)致嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合癥(SARS)的病毒被認(rèn)為在2002年從果子貍身上傳染給人類。在此次疫情爆發(fā)初期,數(shù)十名感染者在武漢華南海鮮市場(chǎng)工作,但是在市場(chǎng)上發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒樣本測(cè)試尚未確定來源。

三個(gè)獨(dú)立的中國(guó)團(tuán)隊(duì)正試圖追蹤冠狀病毒的起源,其中一個(gè)來自中國(guó)疾病預(yù)防控制中心,另一個(gè)來自中國(guó)科學(xué)院。

溝通不暢

廣州的華南農(nóng)業(yè)大學(xué)的研究人員在2月7日的新聞發(fā)布會(huì)上建議將穿山甲作為動(dòng)物來源。穿山甲的肉和鱗片在中國(guó)備受追捧。后者多用于傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)。盡管在中國(guó)作為世界禁令的一部分禁止銷售穿山甲,但它們?nèi)杂猩贁?shù)在東南亞和非洲國(guó)家走私。研究人員說,他們?cè)谧咚降拇┥郊字邪l(fā)現(xiàn)了一種冠狀病毒,與目前感染人的病毒有99%的遺傳匹配。

但是結(jié)果實(shí)際上并沒有涉及整個(gè)基因組。該研究的作者說,實(shí)際上,它與一個(gè)稱為受體結(jié)合域(RBD)的特定位點(diǎn)有關(guān)。2月20日,他們?cè)贐ioRxiv上在線發(fā)表了分析結(jié)果。華南農(nóng)業(yè)大學(xué)教授、論文的共同作者肖立華解釋說,新聞發(fā)布會(huì)的報(bào)告是“生物信息學(xué)小組與研究實(shí)驗(yàn)室之間令人尷尬的溝通錯(cuò)誤”。全基因組比較發(fā)現(xiàn),穿山甲病毒和人類病毒共享其DNA的90.3%。

RBD是冠狀病毒的重要組成部分,它使它們能夠鎖定并進(jìn)入細(xì)胞。杜克-新加坡國(guó)立大學(xué)醫(yī)學(xué)院的病毒學(xué)家Linfa Wang說,即使兩種病毒的RBD之間有99%的相似性也不一定足以將它們聯(lián)系起來。

距離不夠近

上周在bioRxiv上發(fā)布了三項(xiàng)類似的比較研究。其中的一篇論文(由一個(gè)國(guó)際研究小組于2月18日發(fā)布)發(fā)現(xiàn),非法販賣穿山甲的冷凍細(xì)胞樣品中的冠狀病毒與人類發(fā)現(xiàn)的病毒共享其DNA的85.5%至92.4%。

2月20日,來自中國(guó)的研究小組發(fā)表了另外兩篇論文,也研究了走私穿山甲的冠狀病毒。該病毒與引起新型冠狀肺炎的病毒相似度分別為90.23%和91.02%

在加拿大漢密爾頓的麥克馬斯特大學(xué)研究冠狀病毒的Arinjay Banerjee說,在確定宿主之前,遺傳相似性應(yīng)高于這些研究報(bào)告。他指出,SARS病毒與果子貍冠狀病毒共享其基因組的99.8%,這就是為什么人們把果子貍視為來源。Banerjee說,如果穿山甲是當(dāng)前疫情的起源,那也不是這些研究中的穿山甲。

關(guān)鍵差異

到目前為止,在中國(guó)云南省的一只蝙蝠中發(fā)現(xiàn)了最接近人類冠狀病毒的冠狀病毒。2月3日發(fā)表的一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),蝙蝠冠狀病毒與引起新冠肺炎的冠狀病毒共享其遺傳物質(zhì)的96%。蝙蝠本可以將病毒傳播給人類,但是兩種病毒的RBD站點(diǎn)之間存在關(guān)鍵區(qū)別。研究人員說,這表明這種特殊的蝙蝠冠狀病毒并沒有直接感染人,而是通過中間宿主將其傳播給人。

中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所的生物學(xué)家蔣志剛說,這些論文提出的問題多于回答。他問道,如果穿山甲是該病毒的來源,并且是從另一個(gè)國(guó)家來的,為什么沒有關(guān)于該地區(qū)有人被感染的報(bào)道?

在武漢江漢大學(xué)研究動(dòng)物行為的Sara Platto擔(dān)心,所有關(guān)于穿山甲是病毒來源的猜測(cè)都可能促使人們殺死穿山甲。SARS爆發(fā)后,大批果子貍被殺。問題不在于動(dòng)物,而在于我們與動(dòng)物接觸。

本文原載于2月26日nature,作者David Cyranoski,清研智庫李梓涵編譯。

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